本中心置主任一人，綜理本中心業務；組長一人，襄助主任處理中心業務；其下設有行政服務組及工程環保組各1人，分別掌理各有關事項。 (一)行政管理組：掌理本中心相關行政業務、出納、庶務、人事管理、園區內公共設施管理維護及其他相關業務等事項。 (二)工程環保組：掌理鳳山工業區污水下水道用戶廢(污)水納管證明、污水聯接使用申請審查、污水處理相關業務、園區環境影響評估管制執行、環境保護申報許可與管理，及其他工務相關業務等事項。
本中心置主任一人，綜理本中心業務；組長一人，襄助主任處理中心業務；其下設有行政服務組及工程環保組各1人，分別掌理各有關事項。
(一)行政管理組：掌理本中心相關行政業務、出納、庶務、人事管理、園區內公共設施管理維護及其他相關業務等事項。
(二)工程環保組：掌理鳳山工業區污水下水道用戶廢(污)水納管證明、污水聯接使用申請審查、污水處理相關業務、園區環境影響評估管制執行、環境保護申報許可與管理，及其他工務相關業務等事項。